La mirada y el Alma de este navarro siempre ha estado vinculada al fútbol desde los años 80 en la que fichó por el CA Osasuna, ascendiendo a su primera plantilla en la temporada 86-87. Tras dos campañas se incorpora al FC Barcelona donde permanece otras dos temporadas, antes de fichar por el Sevilla FC donde demostró su valía durante 7 temporadas.
Dejó huella su paso como portero en clubes como CD Tenerife y Real Oviedo, antes de regresar al equipo de su ciudad, CA Osasuna donde se retira en junio de 2003. Internacional con la selección española sub-18; sub-19 y sub-21, fue subcampeón del Mundial juvenil en 1985.
Su carrera continuará como entrenador de porteros en el FC Barcelona y 2º entrenador; y ya como técnico en CD Numancia; Racing de Santander; RC Celta y Girona FC.
Juan Carlos Unzué recibió la Medalla de Oro al Mérito Deportivo de Navarra en 2021y es desde 2022, el XIII Dorsal de Leyenda del Sevilla FC.
Desde junio de 2020, juega “el partido más importante de su vida”, frente a la enfermedad de la ELA (esclerosis lateral amiotrófica).